Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CCNA2P20248 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CCNA2P20248 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CCNA2P20248 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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CCNA2P20248 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CCNA2P20248 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CCNA2P20248 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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