Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XBP1P17861 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XBP1P17861 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms