Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC130P13994 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC130P13994 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms