Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEFHP12036 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms