Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms