Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms