Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms