Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA4P06727 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA4P06727 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA4P06727 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms