Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP2O95045 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms