Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM63AO94886 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms