Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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