Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC7A4O43246 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms