Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PODXLO00592 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PODXLO00592 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PODXLO00592 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PODXLO00592 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PODXLO00592 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PODXLO00592 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PODXLO00592 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PODXLO00592 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PODXLO00592 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms