Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms