Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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