Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms