Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME2A4GXA9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms