Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms