Protein–RNA interactions for Protein: A2A3L6

TTC24, Tetratricopeptide repeat protein 24, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC24A2A3L6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC24A2A3L6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms