Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms