Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms