Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms