Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VAPAQ9P0L0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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VAPAQ9P0L0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VAPAQ9P0L0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VAPAQ9P0L0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VAPAQ9P0L0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAPAQ9P0L0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VAPAQ9P0L0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VAPAQ9P0L0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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