Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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