Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT82Q9NSB4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT82Q9NSB4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT82Q9NSB4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT82Q9NSB4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT82Q9NSB4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT82Q9NSB4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT82Q9NSB4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT82Q9NSB4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms