Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms