Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms