Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms