Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms