Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM2Q9C040 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM2Q9C040 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM2Q9C040 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TRIM2Q9C040 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TRIM2Q9C040 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TRIM2Q9C040 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TRIM2Q9C040 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TRIM2Q9C040 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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