Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms