Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms