Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms