Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms