Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms