Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD4Q96M96 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms