Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms