Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms