Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HGDQ93099 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HGDQ93099 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HGDQ93099 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HGDQ93099 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HGDQ93099 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HGDQ93099 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HGDQ93099 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HGDQ93099 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HGDQ93099 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HGDQ93099 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HGDQ93099 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HGDQ93099 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HGDQ93099 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HGDQ93099 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HGDQ93099 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HGDQ93099 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HGDQ93099 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HGDQ93099 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HGDQ93099 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HGDQ93099 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HGDQ93099 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HGDQ93099 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HGDQ93099 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HGDQ93099 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HGDQ93099 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms