Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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COPS9Q8WXC6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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COPS9Q8WXC6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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