Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PYDC1Q8WXC3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PYDC1Q8WXC3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms