Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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