Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC112Q8NEF3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms