Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CNNM3Q8NE01 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNNM3Q8NE01 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms