Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms