Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms