Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms