Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDZK1Q5T2W1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms