Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPANXN4Q5MJ08 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN4Q5MJ08 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms