Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SDK2Q58EX2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms